ExtMail Pro 是在ExtMail开源版的基础上进行了大量的重写和优化、改进后的产品，在便利性、安全性上相比，有着非常大的优势，经过近年的发展，专业版有着长足的进步，目前主要区别体现在如下几个方面：
安全性
开源版安全性相对比较弱，经常会有用户出现密码被盗，系统被滥发垃圾信导致IP被封设置通讯录整个导出等问题。反观专业版在安全性方面做了相当大的努力，增加了大量安全技术和功能，例如频率控制、防扫描、防DOS、密码强度控制、密码有效期甚至两步验证（增值功能）等，这极大的提升了安全性，最大限度降低了因用户密码简单或字典扫描被破解引起的滥发垃圾邮件或信息泄密问题。
安全有关信息请参考《ExtMail pro专业版安全白皮书
反垃圾邮件
开原版的反垃圾邮件功能相对薄弱，缺乏足够的整体安全设计，垃圾邮件过滤能力稍差一些，而专业版完全重写了SMTP行为过滤、内容关键字过滤、发送和接收控制、指纹同步、频率控制等组件及模块，配合更完善的系统过滤机制，实现更好的过滤效果。
下表是两者主要的技术及功能区别：
| 要点 | 开源版 | 专业版 |
| Milter模块 | × | √ |
| 行为过滤能力 | 弱 | 强 |
| 指纹过滤 | √ | √ |
| 指纹更新 | × | √ |
| 病毒更新 | 自动+客户人工 | 自动+维保服务 |
| 关键字过滤 | × | √ |
| RBL | 普通 | 改进型 |
| SPF | v1 | v2 改进型 |
| DKIM验证 | × | √ |
| 频率控制 | × | √ |
| 黑白名单 | 命令行管理 | 图形化管理 |
基础功能
ExtMail Pro基于容器式虚拟化模板技术，一体化设计，比开源版的集成度更高。功能方面拥有大量开源版所不具备的功能；
例如：自助查询，邮件取消，邮件召回，拦截查询，登录查询，文件中转外链，定时发送，支持云等。
所有的功能都是全内置，无需第三方应用或开源软件支持，具有明显的集成优势。
Web界面
专业版WebMail 具有163、qq的主流风格，外观大方，使用简便。而开源版的webmail界面则比较简单。专业版管理后台完全重新设计，使用了先进的MVC结构，UI使用了大量的js并设计了全新的操作流程，相比开源版而言，功能强大，且设计合理，便于使用，让人觉得非常舒服。
安装
ExtMail Pro专业版基于容器式虚拟化技术部署，连带CentOS和ExtMial Pro都集成到容器模板中，部署时只要按照手册安装好LVOS（我们特定的虚拟化管理光盘），直接套用ExtMial Pro的容器模板，仅仅需要30秒即部署好邮件系统和操作系统！相对应的，ExtMail 开源版需要参考冗长的文档进行一个一个软件包部署，即便使用EMOS，也需要至少15-20分钟进行系统安装和分区配置。
维护成本
ExtMail开源版由大量第三方开源软件组成，虽然灵活，但维护的人力成本非常巨大，对维护人员的技术水平要求也很高，还需要运用cat，grep，awk等shell命令对系统的日志，配置文件进行管理维护，缺乏标准化流程和图形化界面。
相反，ExtMail Pro专业版通过图形化界面，将日志管理、收发记录及统计、查询都集成在后台，管理员可以无需shell就能对日志进行查看，极大降低维护成本，简化维护的工作量。
增值功能
ExtMail Pro除了丰富的基础功能外，还能和我司其他大量增值套件集成，提供更高级的功能。例如：AD同步套件，LisPush手机电邮，海外中继服务，动态密码，双机热备等。
通过这些增值模块（需要选购）用户能实现基础邮件功能以外功能的要求。
服务与升级
服务和升级时开源版和收费版最大区别之一。在维保期间内，我司提供专业级的5×8或7×24技术支持和维护服务，用户任何邮件相关的问题都能获得支持和解决，免除了企业遇到邮件问题而不能迅速解决的烦恼。开源版用户则必须由自己完成这些技术工作，出问题也无法获得厂家的支持，维护好坏取决于技术人员的水平和经验，质量完全得不到保证。